深圳已拥有经国务院批准对外开放的一类口岸15个。其中：公路口岸6个，分别是罗湖、文锦渡、皇岗、沙头角、深圳湾、福田口岸；铁路口岸1个，广深港高铁西九龙站口岸；水运口岸7个，分别是盐田港、大亚湾、梅沙、蛇口、赤湾、妈湾、大铲湾口岸；航空口岸1个为深圳宝安国际机场。罗湖口岸是深圳市客流量最大的旅客入出境陆路口岸，目前客流量仍居全国前三甲；皇岗口岸是目前我国货车入出境数量最多的客货综合性公路口岸，也是我国率先实行24小时通关的口岸；深圳湾口岸是我国第一个按照“一地两检”查验模式运作的客货综合性公路口岸；文锦渡口岸是我国最早对外开放的口岸之一；福田口岸是我国首个内地与香港无缝接驳的地铁口岸；盐田港口岸是我国四大国际中转深水港之一；蛇口港口岸是第一个由企业自筹资金建设、管理和经营的海港口岸；赤湾口岸是第一个中外合资港口企业建设和经营的海港口岸；深圳宝安国际机场是我国第一家以地方投资为主兴建的机场，是我国四大航空港之一。
深圳海关分一线海关和二线海关。一线海关指申报之后直接可以出境的海关。而二线海关指申报之后必须再通过一线海关再报关才能出口的海关。
深圳海关总署共有几个一线海关： 大鹏海关、蛇口海关、文锦渡海关、皇岗海关、沙头角海关，其中蛇口海关又包括以下几个码头；SCT （SHEKOU）、 赤湾（CHIWAN，赤湾码头在凯丰码头对面，现已合并为一家公司对外称赤湾）、妈湾 （MAWAN ）、招港 （ZHAOGANG）、大铲湾，东角头（进口码头）。其中中港拖车—陆路口岸：文锦渡、皇岗、沙头角
一线海关当中又分为船运和路运海关，五个一线海关当中大鹏海关和蛇口海关为船运海关，文锦渡海关、皇岗海关、沙头角海关为路运海关。
二线海关如笋岗海关、福田保税区海关等。盐田的怡和仓、文辉物流、马士基物流等保税仓直接向大鹏海关申报。湖北仓、梅园仓、603仓等海关监管仓库向笋岗海关申报。
一、深圳进口报关流程。
1、准备报关资料（合同、发票、装箱单、提运单）
2、填写报关手写草单。根据报关资料填写一份报关单草单
3、打印报关复核表。报关公司根据草单，在QP系统上录入数据，打印出报关复核用单
4、发送数据。核对报关资料与复核单无误后，报关公司操作员用报关员卡向电子口岸发送报关单数据
5、收到数据回执。海关审单中心接受到数据，初步审核无误后，发送数据回执
6、打印出报关单。报关行收到数据回执后，说明海关接受申报，然后可以在QP系统上打印出报关单一式三联（海关核销联、海关作业联、企业留存联）
报关流程
7、订好报关单。报关员确认后，在报关单上签名、盖报关章，并在各联报关单随附订好海关要求的资料
8、现场递单申报。拿订好后的报关单，向现场海关递单申报
9、审单。现场海关审核无误后，接受申报
10、征税。如进口货物达到征税数额，海关会打出税单给报关员
11、交税。企业根据税单到指定银行帐户交税，银行在税单上盖是收讫章（开通网上支付的企业可以网上支付）
12、税单核销。现场海关根据银行盖的收讫章核销税单
13、选择查验。人工布控–现场海关根据货物的风险值选择是否查验货物（如果是电脑布控的话，那就必须要查验货物）
14、放行。海关将查验后的货物或无需查验的货物放行
15、提取海关放行后的货物
16、结关。海关将上述报关单货物结关，报关行方可打印进口付汇证明联
二、深圳进口报关资料:
1．一般贸易进口报关:
1).报关委托书(盖收货人章)
2).装箱单(盖发货人章)
3).发票(盖发货人章)
4).合同
5).提单(B/L)
6).提货单(D/O)
7).商检、动植检、许可证等海关所需单证
2、进口转关所需报关资料：
1).发票(发货人章)
2).装箱单(发货人章)
3).司机纸(转关纸)(发货人、收货人、车行章)
4).提单(B/L)
5).提货单（D/O）
6).司机本(大鹏海关备案)
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